
Bozcaada merkez, Cumhuriyet mahallesi, 20 Eylül Caddesi’nde bulunur. Moloz taş ve tuğla malzeme ile yapılmıştır. Alaturka kiremitli kırma çatılıdır. 1876 yılındaki çıkan yangından zarar gören kilise onarılmış, 8 Temmuz 1890 tarihinde ibadete açılmıştır.sonra yeniden planlanan kent planı kapsamında yapılmıştır. Kilisenin giriş kapısı üzerindeki kitabede 1869 yılında yapıldığı yazılıdır.
Avlusunun 20 Eylül Caddesine bakan cephesi üzerinde çan kulesi bulunmaktadır. Kesme taştan dört katlı olarak yapılan kule, 1895 yılında kiliseden sonra inşa edilmiştir. Kule, 2006 yılında tamamen onarılmıştır. Meryem Ana Kilisesi adıyla da bilinen bu kutsal mekân, Bozcaada’da bulunan ve çok az sayıdaki Rum Ortodoks halkına hizmet veren tek kilisedir.